Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms