Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK2Q9UPX8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms