Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALKQ9UM73 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKQ9UM73 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms