Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms