Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms