Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms