Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms