Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms