Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms