Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms