Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
POLKQ9UBT6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms