Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGC1AQ9UBK2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms