Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SH3BP4Q9P0V3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SH3BP4Q9P0V3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SH3BP4Q9P0V3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SH3BP4Q9P0V3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SH3BP4Q9P0V3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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