Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms