Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms