Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSD3Q9NYI0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms