Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms