Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK1Q9NYA1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPHK1Q9NYA1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPHK1Q9NYA1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPHK1Q9NYA1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPHK1Q9NYA1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPHK1Q9NYA1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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