Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN6Q9NWW5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms