Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms