Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDP1Q9NUW8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDP1Q9NUW8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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