Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFSP2Q9NUQ7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms