Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms