Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TM7SF3Q9NS93 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms