Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms