Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NRIP3Q9NQ35 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms