Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms