Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms