Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRA1Q9HD15 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms