Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSER1Q9C0I3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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