Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms