Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC46A2Q9BY10 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC46A2Q9BY10 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms