Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms