Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARD11Q9BXL7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARD11Q9BXL7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms