Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms