Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms