Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms