Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms