Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms