Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2BQ99453 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms