Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3AQ96ST3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms