Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms