Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms