Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OPALINQ96PE5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms