Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP4Q96P64 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP4Q96P64 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms