Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms