Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM47Q96LD4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms