Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZA3Q96KX2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms