Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms