Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZC2HC1AQ96GY0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZC2HC1AQ96GY0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms